Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TDP1Q9NUW8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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