Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CENPJQ9HC77 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms