Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NRDE2Q9H7Z3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NRDE2Q9H7Z3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms