Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ZCCHC2Q9C0B9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZCCHC2Q9C0B9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms