Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SMIM3Q9BZL3 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SMIM3Q9BZL3 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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