Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL359541.1-201ENST00000431097 575 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS4B-207ENST00000591519 551 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010680.5-201ENST00000605021 463 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZRANB2-207ENST00000611683 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022558.3-201ENST00000616598 688 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPC5OS-203ENST00000635763 955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01194-202ENST00000505877 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms