Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SLC4A5Q9BY07 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms