Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SALL3Q9BXA9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SALL3Q9BXA9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms