Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
NICN1Q9BSH3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms