Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms