Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NUP88Q99567 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms