Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD180Q99467 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD180Q99467 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD180Q99467 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms