Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYCBPQ99417 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYCBPQ99417 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYCBPQ99417 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYCBPQ99417 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
MYCBPQ99417 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MYCBPQ99417 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms