Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CDRT15Q96T59 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.3 ms