Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8L2Q96SF2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms