Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CNBD2Q96M20 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms