Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C9orf43Q8TAL5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms