Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TTC29Q8NA56 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms