Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RTL3Q8N8U3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms