Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LNX2Q8N448 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms