Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LMNTD2Q8IXW0 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms