Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LPCAT2Q7L5N7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms