Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC149Q6ZUS6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC149Q6ZUS6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC149Q6ZUS6 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC149Q6ZUS6 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC149Q6ZUS6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC149Q6ZUS6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC149Q6ZUS6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC149Q6ZUS6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC149Q6ZUS6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms