Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms