Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV28

TMEM225, Transmembrane protein 225, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225Q6GV28 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TMEM225Q6GV28 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms