Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms