Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SLC39A12Q504Y0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms