Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZM63

ETDB, Embryonic testis differentiation homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETDBQ3ZM63 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 ESYT3-202ENST00000389567 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 ARHGEF2-206ENST00000462460 4438 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 AC015921.1-201ENST00000574885 2546 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 LPO-204ENST00000543544 2350 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
ETDBQ3ZM63 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms