Protein–RNA interactions for Protein: Q17RQ9

NKPD1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKPD1Q17RQ9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
NKPD1Q17RQ9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms