Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CA9Q16790 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CA9Q16790 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CA9Q16790 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CA9Q16790 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CA9Q16790 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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CA9Q16790 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CA9Q16790 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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CA9Q16790 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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CA9Q16790 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CA9Q16790 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CA9Q16790 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CA9Q16790 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CA9Q16790 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CA9Q16790 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CA9Q16790 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CA9Q16790 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CA9Q16790 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CA9Q16790 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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