Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FSCN1Q16658 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FSCN1Q16658 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms