Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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