Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZIC1Q15915 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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