Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VPS72Q15906 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
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