Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNA6Q15825 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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