Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PTPRKQ15262 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PTPRKQ15262 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
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