Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EEA1Q15075 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms