Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SEMA3AQ14563 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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