Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNGB1Q14028 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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