Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK13Q14004 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK13Q14004 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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