Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KCNC3Q14003 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms