Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CBFBQ13951 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CBFBQ13951 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CBFBQ13951 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CBFBQ13951 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CBFBQ13951 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CBFBQ13951 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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CBFBQ13951 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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CBFBQ13951 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CBFBQ13951 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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