Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGA9Q13797 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms