Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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NCOA4Q13772 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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NCOA4Q13772 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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NCOA4Q13772 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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