Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FHL3Q13643 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FHL3Q13643 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms