Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PKD2Q13563 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PKD2Q13563 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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