Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NEUROD1Q13562 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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