Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ATRQ13535 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ATRQ13535 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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