Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms