Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDCLQ13371 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms